20 октября 2018 года по благословению Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла на сестринском кладбище Пюхтицкого Успенского ставропигиального женского монастыря в Эстонии члены Комиссии по обретению мощей блаженной старицы монахини Екатерины (Малков-Паниной) обрели честные останки святой.
В Комиссию, которую возглавил митрополит Таллинский и всея Эстонии Евгений, вошли: епископ Арцизский Виктор, викарий Одесской епархии; игумения Филарета (Калачева), настоятельница Пюхтицкого монастыря; протоиерей Олег Митров, член Синодальной комиссии по канонизации святых; доктор исторических наук Н.И. Платонова, археолог, ведущий научный сотрудник Отдела славяно-финской археологии Института истории материальной культуры РАН (Санкт-Петербург); кандидат исторических наук А.В. Зубова, антрополог, старший научный сотрудник Отдела антропологии Музея антропологии и этнографии РАН (Санкт-Петербург); иеромонах Иона (Головастиков), настоятель храма великомученицы Екатерины в Пярну; протоиерей Виталий Гаврилов, настоятель храма Нарвской иконы Божией Матери в г. Нарва.
На обретении мощей присутствовали сестры Пюхтицкого монастыря, духовенство Эстонской епархии, паломники.
В настоящее время обретенные честные останки описываются специалистами археологом Н.И. Платоновой и антропологом А.В. Зубовой, затем их подготовят к облачению по монашескому чину.
Имеется много убедительных свидетельств о святости подвижницы и обильных благодатных дарах, проявлявшихся при ее жизни и после смерти в очевидных чудотворениях, в том числе исцелениях (некоторые из них подтверждены медицинскими документами).
7 марта 2018 года Священный Синод Русской Православной Церкви постановил причислить монахиню Екатерину (Малков-Панину) к лику святых для местного почитания в Пюхтицком Успенском ставропигиальном женском монастыре (журнал № 7). Память блаженной Екатерины, Христа ради юродивой, положено совершать 22 апреля (5 мая). 20 марта 2018 года в Пюхтицком монастыре состоялось прославление блаженной старицы Екатерины.
