Ежегодно 5 декабря, в годовщину со дня кончины приснопамятного Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II, в Зачатьевском монастыре совершается сугубое молитвенное поминовение пятнадцатого Предстоятеля Русской Православной Церкви. Накануне служится заупокойное богослужение — парастас, а в сам день памяти — заупокойная Литургия и панихида.
По традиции настоятельница монастыря, заместитель председателя Синодального отдела по монастырям и монашеству игумения Иулиания (Каледа) с сестрами посещают Богоявленский кафедральный собор 4 декабря вечером, где молятся на заупокойной утрене, возглавляемой первым викарием Патриарха Московского и всея Руси митрополитом Истринским Арсением, и 5 декабря утром, когда совершается архиерейское богослужение — Литургия и панихида.
В преддверии десятой годовщины со дня кончины приснопамятного Святейшего Патриарха Алексия II глубокая почитательница Предстоятеля итальянская писательница Анжелика Карпифаве передала в дар Зачатьевскому монастырю старинные фамильные реликвии — святыни, связанные со святым апостолом и евангелистом Иоанном Богословом, и частицу мощей святителя Николая Чудотворца. Патриарх Алексий II принимал близкое участие в восстановлении и возрождении Зачатьевской обители и, по мнению Анжелики Карпифаве, являлся «настоящим духовным отцом» монастыря.
Ранее, к юбилейному году памяти Святейшего Патриарха Алексия II, в издательстве «Эксмо» вышла книга Анжелики Карпифаве «Святейший Патриарх Алексий II: беседы о Церкви в мире» (книга рекомендована Издательским Советом Русской Православной Церкви).